现时大部分海关当局同样需要一个灵活的机制，以应付复杂的国际供应链问题及执行相关的保安工作。长远而言，香港海关需要为发展相互认可协议而按照国际标准推行「香港认可经济营运商计划」，亦可因应个别公司的业务模式、运作规模、风险概况及其他相关因素，具弹性地制定保安措施。
海关为配合业界的不同需要，为参与夥伴计划的公司提供两个级别的认可经济营运商资格。海关将评估公司在符合既定的准则方面已达到的水平，并据此授予分级认证，准则列明如下：－
| 一般准则 | 第一级 | 第二级 |
|---|---|---|
| · 海关规定的信用证明 | √ | √ |
| · 备存良好的商业纪录管理系统 | √ | √ |
| · 企业财务健全 | √ | √ |
| 保安及安全准则 | 第一级 | 第二级 |
|---|---|---|
| · 场所安全及进出管制 | √ | √ |
| · 人员安全 | √ | √ |
| · 货物安全 | √ | √ |
| · 货运工具的安全 | √ | √ |
| · 业务夥伴的安全 | √ | √ |
| · 保安教育及培训 | √ | √ |
| · 资料交换、存取及保密性 | √ | √ |
| · 危机管理及事故复原 | - | √ |
| · 评鉴、分析及改善 | - | √ |
参与计划的公司应该遵守这些认证准则列明的规定，以提升其保安措施及标准。为测试公司是否就参与认证计划作好准备，公司须先根据这些既定的准则，对其内部政策和运作程序进行自我评估。海关人员收到申请文件后，将透过实地验证确定该公司已推行有关安全措施及程序。