助理貿易管制主任的主要職責包括執行與保障消費者權益(包括產品安全、商品說明及公平貿易)、產地來源證、就禁運物品申領的進出口許可證，以及進出口報關事宜等相關的法例；就工廠登記及根據簽發產地來源證制度提出的有關申請，巡查處所及營運單位；在各出入境管制站及／或其他處所檢查進口或出口貨物；查核進出口報關單，並評定進出口貨物的價值，以徵收報關費及成衣業訓練附加稅；執行金錢服務經營者的發牌及規管工作，包括審查有關機構是否遵從規定，以打擊洗錢及恐怖分子資金籌集；以及根據相關法例執行調查工作。助理貿易管制主任主要在戶外工作，並且可能須不定時工作，或輪班當值及／或執行隨時候召職務、以及採取拘捕行動並在法庭上作供。